Als Arthur Conan Doyle Sherlock Holmes in enige mate op een echt persoon gebaseerd was, was het op zijn voormalige professor, forensisch patholoog Dr. Joseph Bell. Deze serie vertelt het fictieve moordonderzoek dat Bell mogelijk had ondernomen met de hulp van de jonge student Doyle.
In een zonovergoten Hawaïaanse stad met een mysterieus verleden, blijft een groep vrienden achter met een duister geheim na een tragisch ongeval. Een jaar later krijgt een lid van de groep een dreigend bericht en de vrienden weten nu dat iemand van plan is hen te laten boeten voor afgelopen zomer.
In de mysterieuze toekomst bewonen kristallijne organismen, Gems genaamd, een wereld die is vernietigd door zes meteoren. Elke edelsteen krijgt een rol toegewezen om te vechten tegen de Lunarians, een soort die hen aanvalt om hun lichamen te verbrijzelen en als decoratie te gebruiken.
Phosphophyllite, ook bekend als Phos, is een jonge en kwetsbare edelsteen die ervan droomt zijn vrienden te helpen bij de oorlogsinspanningen. In plaats daarvan wordt hen opgedragen een encyclopedie samen te stellen vanwege hun kwetsbare toestand. Nadat Phos met tegenzin aan deze taak is begonnen, ontmoet hij Cinnabar, een intelligente edelsteen die 's nachts op het afgelegen eiland moet patrouilleren vanwege het bijtende gif dat hun lichaam aanmaakt. Nadat Phos heeft gezien hoe ongelukkig Cinnabar is, besluit hij een rol te zoeken waar beide afgewezen edelstenen van kunnen genieten.
Ron Kamonohashi werd ooit beschouwd als een genie op de beste detective-opleidingsacademie. Maar na een fatale fout werd hij van school gestuurd en werd hem verboden rechercheur te worden. Jaren later klopt politieagent Totomaru Isshiki op de deur van Ron om hulp te zoeken bij een seriemoordzaak. Hij vindt Ron, nu een kluizenaar met warrig haar, die hem wil helpen. Samen begint dit niet-overeenkomende detectiveteam hun eerste mysterie op te lossen!