Twee moorden verbrijzelen een toch al verdeelde gemeenschap, wat leidt tot een van de grootste klopjachten in de Britse geschiedenis, terwijl de historische verdeeldheid, ontstaan tijdens de Mijnwerkersstaking drie decennia eerder, dreigt te worden aangewakkerd.
Het verhaal draait om een eerstejaars middelbare scholier, Teiichi Niiya, die zich net had ingeschreven aan de Seikyou Private Academy. Wanneer hij verdwaalt in een van de oude schoolgebouwen, ontmoet hij een meisje genaamd Yuuko Kanoe, die zichzelf openbaart als een geest zonder herinneringen. Teiichi besluit vervolgens haar dood te onderzoeken door samen met Kirie Kanoe, Yuuko's familielid, en de onbewuste tweedejaars Momoe Okonogi diep in de beruchte Zeven Mysteries van de legendarische school te duiken. Door het hele verhaal heen ontdekken Teiichi en Yuuko de waarheid over deze spookverhalen en helpen ze degenen die in de problemen zitten, terwijl ze steeds dichter bij de waarheid achter Yuuko's dood komen.
In een toekomst waarin de lucht is veranderd in een gigantische spiegel, raken twee tienerkinderen verwikkeld in een strijd tussen een groep superkrachtige wezens en een mysterieus vrouwenteam dat hen wil tegenhouden.
Wixoss is een kaartspel dat populair is bij tieners. Vermoedelijk bestaan er 'lrig -kaarten', vrouwelijke karakterkaarten met eigen wil. Speciale meisjes kunnen de stemmen van de Lrigs horen, en degenen die ze bezitten worden 'selectors' genoemd. Deze selectors hebben kaartgevechten in een dimensie waar andere mensen geen toegang toe hebben. Er wordt gezegd dat degene die in deze gevechten triomfeert, zijn wens zal worden verleend. Ruko Kominato is het nieuwste meisje dat een LRIG -kaart vindt. Ze noemt de hare Tama, en zonder verdere uitleg wordt in haar leven gegooid als een selector.
De scherpe, geestige en raadselachtige inspecteur Annika Strandhed leidt een nieuwe specialistische Marine Homicide Unit (MHU) die belast is met het onderzoeken van onverklaarbare, brutale en schijnbaar ondoorgrondelijke moorden.
Shokuzai vertelt het verhaal over een klein Japans dorp waar vijftien jaar geleden het noodlot toesloeg toen het basisschoolmeisje Emily door een vreemde man werd vermoord. Vier klasgenoten met wie Emily aan het spelen was, vinden haar lichaam. De dader wordt nooit gevonden en de zaak blijft onopgelost. Verscheurd van verdriet roept Emily's moeder Asako een soort vloek over de vier meisjes uit, die zeggen zich het gezicht van de dader niet te kunnen herinneren. Ze zullen elk op hun eigen manier boete doen voor hun zwijgen.
Michio Iruma is een voormalig advocaat. Hij werkt nu als rechter bij de eerste strafrechtbank (algemeen bekend als 'Ichikei') van de rechtbank van Tokio. Hij is een ongebruikelijke rechter. Om verkeerde oordelen te voorkomen, zoekt Michio Iruma naar de waarheid in zaken door zelf inspecties ter plaatse uit te voeren. Hierdoor zijn advocaten en aanklagers bang voor hem.
