De stad Daten City ligt ergens tussen hemel en hel. Hier voeden boze geesten zich met menselijke rancune en verlangens. Twee mysterieuze figuren bestrijden de bovennatuurlijke krachten met hun goddelijke licht: de losgeslagen zusjes Panty & Stocking. Deze gevallen engelen willen de duisternis verdrijven en de wereld zuiveren. Maar zijn ze nu afgezanten van God of knechten van de duivel?
Akihabara is het centrum van het universum voor de coolste hobby's en meest eigenzinnige amusement. In het voorjaar van 1999 verhuist de helderogige Nagomi Wahira daarheen met de droom om zich bij een meidencafé aan te sluiten. Ze trekt snel een schort aan bij café Ton Tokoton, oftewel de Varkenshut. Maar je aanpassen aan het leven in het bruisende Akihabara is niet zo eenvoudig als het serveren van thee en het verrassen van klanten. Samen met de strenge Ranko, die nooit lijkt te glimlachen, moet Nagomi haar best doen om de Varkenshut te verheffen boven alle andere meidencafés die strijden om de hoogste ranglijst. Onderweg zal ze een plek voor zichzelf vrijmaken te midden van de franjes en spanning van het leven in de Varkenshut. Net wanneer Nagomi's dromen binnen haar bereik zijn, ontdekt ze dat niet alles is wat het lijkt in de meidencafés van Akihabara.
Danganronpa 3: Despair speelt zich af vóór de gebeurtenissen uit Danganronpa: Trigger Happy Havoc. Chisa Yukizome is een nieuwe leraar aan de Hope's Peak Academy en wordt de directeur van klas 77. Ondertussen biedt een talentloze leerling uit het reservaat zich vrijwillig aan om experimenten te ondergaan die gericht zijn op het creëren van de 'Ultieme Hoop'. Het verhaal volgt alle gebeurtenissen die aanleiding zullen geven tot de “Ultieme Wanhoop” en vervolgens tot de Tragedie4.
Sakurasou, de slaapzaal voor probleemstudenten. Dit is waar Kanda Sorata woont. Op een dag trekt de jonge Shiina Mashiro daar in. Kanda voelt zich onmiddellijk tot haar aangetrokken en vertrouwt zichzelf de taak toe haar te beschermen tegen de 'echte' probleemstudenten. Maar Shiina is niet zoals elk ander meisje: aan de ene kant is ze zeer getalenteerd en begaafd, aan de andere kant kan ze niet alleen leven. Dit leidt tot een zeer onwillige relatie...
De Angel Brigade, een elitetak van het leger van het Transbaal Empire, krijgt de opdracht om te zoeken naar The Lost Technology, mysterieuze voorwerpen uit het verleden met onbekende krachten. Onder leiding van kolonel Volcott O'Huey, die binnenkort met pensioen gaat, reist de Angel Brigade naar verschillende planeten met behulp van hun speciaal ontworpen Emblem Frame-schepen om op zoek te gaan naar verloren technologie. Helaas maken ze een fout en komen ze in allerlei ongemakkelijke en lastige situaties terecht.
Het verhaal begint wanneer Izumi Hayato deelneemt aan de verkiezingen voor de voorzitter van de studentenraad. Hij is echter niet de enige die president wil worden. Een jong en mooi meisje genaamd Wakana Ui stelt zich ook kandidaat voor een ambt. Deze laatste beloofde liefde en romantiek door condooms in het publiek te gooien. Het was toen dat onze jonge hoofdpersoon de verkiezingen verloor en vice-president werd. Als hij thuiskomt, vertellen zijn ouders hem dat hij het slachtoffer is van een gearrangeerd huwelijk en dat zijn verloofde niemand minder is dan Wakana Ui.
Nadat hij uit de onderwereld is verdwenen, duikt de legendarische yakuza, bekend als de 'Onsterfelijke Draak', weer op als een zeer toegewijde thuisblijvende echtgenoot.
Mina Tepeş, de prinses van het oude verbond en heerser van alle vampiers, wil dat haar ras zich niet meer verbergt voor de mensen. Met behulp van haar enorme rijkdom heeft ze de volledige staatsschuld van Japan afbetaald en daarmee het recht gekregen om een district voor de kust van Japan te creëren dat de toekomstige haven voor vampiers over de hele wereld moet worden. Maar wanneer ze eindelijk probeert het bestaan van vampiers aan de wereld bekend te maken, smeden sommige politici, terroristen en rivaliserende facties een complot om Mina te vermoorden voordat ze de kans krijgt om de Japanse en internationale erkenning voor de Vampire Bund te krijgen. Nu moet ze vertrouwen op haar kracht, wreedheid en degenen die het dichtst bij haar staan, terwijl ze probeert een normaal leven op te bouwen.
Wanneer twee huurmoordenaars een gevaarlijke gangster uitschakelen, is het laatste wat ze verwachten dat hij een vierjarig dochtertje krijgt, dat inmiddels wees is. Maar wanneer ze besluiten de voogdij over het kind over te nemen, staat hun leven op zijn kop! Tussen een missie hier en een vuurgevecht daar zullen de twee ingehuurde moordenaars tijd moeten vinden om voedzame maaltijden te bereiden, de intellectuele groei van het kind te stimuleren en de kleine naar de kinderopvang te brengen!
Mike Tyson brengt het gevecht van de boksring naar de straat... door mysteries op te lossen! Geholpen door het Mike Tyson Mystery Team – de geest van de markies van Queensberry, Mike’s geadopteerde Koreaanse dochter en een duif die ooit een man was – zal Mike Tyson elk pleidooi beantwoorden dat naar hem wordt gestuurd.
Masaru, is een tweedejaars junior high -student en is ongeslagen in de strijd, hij ontmoet het digitale monster Agumon, die is ontsnapt uit DATS, een geheime overheidsorganisatie. Ondanks vreselijke eerste indrukken worden de twee beste vrienden door te praten met hun "vuisten". Met anderen,
Masaru en Agumon werken aan het onderzoeken van verschillende incidenten met de digitale wereld en digitale monsters, om de kern van de zaak te achterhalen.
Tenma Tsukamoto is verliefd, zoals het een 16-jarig meisje betaamt. Maar hoe charmant ze ook is, ze is ook onhandig en gebruikt onverschrokken nogal ongebruikelijke methoden om de interesse van haar verliefdheid Ohji Karasuma te wekken. Hiervoor moeten liefdesbrieven met pijl en boog door de lucht vliegen en moet een riskante ontsnapping uit het toiletraam worden geaccepteerd.