Twee krijgskunstenaars worden op brute wijze vermoord door een team van huurmoordenaars, waardoor hun beschermelingen, een jongen en een meisje, weerloos achterblijven. Een vechtsportmeester stuurt de moordenaars weg, spaart hun leven en besluit ze in huis te nemen. Hij creëert ze en geeft les in vechtsporten.
De Honnouji Academie wordt krachtig geregeerd door de ijzeren controle van de studentenraad en de president, Satsuki Kiryuuin. Transferstudent Ryuuko Matoi arriveert op de campus met een gigantisch zwaard, dat eigenlijk de helft van een schaar is. Ze is op zoek naar de vrouw die de andere helft van haar zwaard vasthoudt en die haar vader heeft vermoord. Er wordt gezegd dat Satsuki Kiryuuin de identiteit van de moordenaar kent, maar wanneer Ryuuko haar confronteert, wordt ze geslagen door de studentenraad en hun krachtige 'goku-uniformen' die ze qua sterkte niet kan evenaren. Zodra Ryuuko echter haar eigen 'Kamui' met de naam Senketsu ontvangt, zijn de kansen in haar voordeel groter.
De setting van het verhaal is een fictieve wereld van overvloedige steden waar mensen samengaan met demonen genaamd Yoma. Deze monsters voeden zich met mensen als hun belangrijkste bron van voedsel, zich verstoppen in de menselijke samenleving totdat ze toeslaan. Een groep bekwame krijgers vormt een naamloze organisatie om mensen tegen deze demonen te beschermen. Deze krijgers worden Claymores genoemd, naar hun immense Claymore-wapens. Ze vermengen zich gewillig met demonenvlees en bloed om krachtige half menselijke hybriden te worden. Dorpen met een aanvalsrisico huren strijders van de organisatie in voor bescherming. Het verhaal van Claymore volgt de avonturen van de mooie Claymore-krijger Claire, die demonen bevecht en worstelt om haar menselijkheid vast te houden. Lang geleden namen de Yoma, de vorm veranderende demonen, de menselijke vorm aan om in vermomming onder hen te leven. Gebaseerd op een shounen manga van Yagi Norihiro geserialiseerd in Monthly Shounen Jump.
De jonge Jedi Kai, Lys en Nubs trainen samen op de planeet Tenoo en gaan op avontuur in het sterrenstelsel met superpiloot Nash in haar Crimson Firehawk!
De nobele Michel Volban is de leider van een opstand onder de sterren, waarin zowel aristocraten als gewone mensen samenkomen en gewapend ten strijde trekken.
Keizer Vetti Sforza, die zichzelf tot 'Heilige Keizer' heeft uitgeroepen, gebruikt zijn macht en manipuleert iedereen om de hemelen van de Melkweg onder zijn heerschappij te verenigen.Door de rook komt een fantastisch glazen slagschip. Het wordt gecontroleerd door Cleo, de laatste van koninklijke bloede en potentiële redder van de door oorlog verscheurde bevolking. Door een toevallige ontmoeting ontmoeten Cleo en Michel elkaar en werken samen tegen de overweldigende vijand.
Nadat de jonge studente Madoka Kaname op een ochtend door haar broertje uit een vreemde droom wordt gerukt, gaat ze zoals gewoonlijk met haar vriendinnen naar school. Daar ontdekt ze echter dat het meisje dat ze kort daarvoor in een droom heeft ontmoet, haar nieuwe klasgenoot Homura Akemi is. Als ze "s middags met haar vriendin Sayaka Miki naar een muziekwinkel gaat, hoort ze plotseling een stem die om hulp vraagt. Als ze de stem volgt, vindt ze een gewond, magisch wezen genaamd Kyubey, dat is opgejaagd door de nieuwe klasgenoot. Wanneer ze het magische wezen niet aan Homura wil overhandigen, glijdt Madoka geleidelijk verder af naar mysterieuze parallelle werelden waar Magical Girls tegen boze heksen vechten. Zullen Madoka en haar vriendin Sayaka het advies van hun beschermer opvolgen en afzien van het worden van Magische Meisjes, of op het verleidelijke aanbod tegen de aanbeveling ingaan?
Keiichirō Nagumo was een geniale rechercheur op de middelbare school. Geen zaak was hem complex genoeg. Maar wat gebeurt er met geniale rechercheurs als ze ouder worden? Nu, 35 jaar oud, met slechte heupen, een falend recherchebureau zonder zaken om op te lossen en moeite om de huur te betalen, zit hij op een dood spoor. Dan komt er een middelbare scholiere op zijn kantoor die zegt dat ze met hem wil werken. Zal de wereldvreemde, ouderwetse Nagumo met haar hulp het vuur van zijn jeugd terugkrijgen?
De serie speelt zich korte tijd na 'Batman: The Animated Series' af, en bevat voor het grootste deel dezelfde personages als die serie. Barbara Gordon / Batgirl is inmiddels officieel lid geworden van Batman’s team. Dick Grayson, voorheen bekend als Batman’s helper Robin, is echter voor zichzelf gaan werken als Nightwing. Daarom rekruteert Batman al vroeg in de serie de jonge Tim Drake als de nieuwe Robin.
