Danganronpa 3: Despair speelt zich af vóór de gebeurtenissen uit Danganronpa: Trigger Happy Havoc. Chisa Yukizome is een nieuwe leraar aan de Hope's Peak Academy en wordt de directeur van klas 77. Ondertussen biedt een talentloze leerling uit het reservaat zich vrijwillig aan om experimenten te ondergaan die gericht zijn op het creëren van de 'Ultieme Hoop'. Het verhaal volgt alle gebeurtenissen die aanleiding zullen geven tot de “Ultieme Wanhoop” en vervolgens tot de Tragedie4.
De meisjes van een literatuurclub op de middelbare school doen een kleine ijsbreker om elkaar te leren kennen: ze beantwoorden de vraag: 'Wat is één ding dat je wilt doen voordat je sterft?' Een van de meisjes flapt eruit: 'Seks.' Ze weten niet dat de wervelwind die door dat woord wordt losgelaten, elk van deze meisjes, met verschillende achtergronden en persoonlijkheden, op hun eigen onhandige, grappige, pijnlijke en emotionele pad naar volwassenheid duwt.
Een vermoord lichaam op een brug tussen El Paso en Juarez brengt El Paso-rechercheur Sonya Cross en rechercheur Marco Ruiz van de Chihuahua State Police samen.
Tazuna is een middelbare scholier uit Osaka, die graag met machines speelt. Op een dag ontvangt hij een reparatieverzoek van een universitair laboratorium. Hij accepteert het verzoek en ontmoet uiteindelijk een meisje genaamd Koyori, die al heel lang bedlegerig is. Plots worden Tazuna en Koyori meegesleurd in een heel andere wereld genaamd 'Ziggurat'. In deze wereld zijn er Hand Shakers, twee mensen die handen aanraken en de Nimrod creëren. Hun doel is om andere Hand Shakers te verslaan om audiëntie te krijgen bij “God”, die hen hun wensen zal vervullen. Bescherm met uw eigen handen!
Het verhaal van Athanasia, de verlaten prinses van het Obeliaanse Rijk, eindigt met haar executie door haar eigen vader - of toch niet? Haar tragische verhaal is de plot van de roman The Lovely Princess. Maar nu is een moderne vrouw die het boek heeft gelezen net wakker geworden als baby Athanasia zelf, gevuld met haar eigen herinneringen en kennis van het verhaal waarin ze vastzit! Vastbesloten om haar gedoemde lot te overleven, begint baby Athanasia aan dit nieuwe leven met een plan: vermijd aandacht en verzamel waardevolle spullen om haar ontsnapping te financieren. Als haar plan misgaat, moet ze zich plotseling een weg banen naar de goede gratie van haar vader, de mooie tirannieke keizer, zodat hij haar niet nog een keer vermoordt!
Shangri-La speelt zich af in het midden van de 21e eeuw, toen de opwarming van de aarde Tokio in een tropische stad veranderde. Om de temperatuur in het hart van de stad met 5°C te verlagen, wordt de stad voor een groot deel bebost. Ondanks de beperkte beschikbare ruimte leidt dit tot een toestroom van klimaatvluchtelingen en roept het tegelijkertijd anti-regerings guerrilla"s op het toneel, die herbebossing willen voorkomen.
Een onzekere kantoormedewerkster is 's nachts een gemaskerde internetpersoonlijkheid. Maar dan haalt een reeks noodlottige gebeurtenissen haar leven overhoop.
Een Britse misdaadserie die in 1978 in Groot-Brittannië werd gemaakt op basis van de misdaadromans van de schrijver Leslie Charteris en de hitserie Simon Templar met Roger Moore, ook gebaseerd op de romans van Charteris.
Het verhaal behandelt verschillende afzonderlijke maar met elkaar verweven verhaallijnen, waarbij de hoofdrolspelers Kiu Fung, Duen Yu en Hui Juk centraal staan.
