Sakaido is een geniale detective die elke crimineel kan opsporen. Maar wanneer zijn dochter wordt vermoord, komt hij uit wraak aan de andere kant van de wet terecht. Nu hij in de gevangenis zit, helpt hij de politie mysteries op te lossen met behulp van een systeem dat iemands identiteit binnendringt. Beetje bij beetje vormt zich een bloedspoor, dat allemaal terugleidt naar de moordenaar van zijn dochter.
Verder gaan van waar 'Het Nieuwe Scooby en Scappy Doo Show' was gebleven. Het voornaamste verschil is dat in het team is nu af en toe vergezeld door Daphne Blake en vrienden om mysteries op te lossen samen.
Verspreid over de Verenigde Staten liggen verlaten bouwwerken, vergeten ruïnes uit het verleden en monumenten uit vervlogen tijden. Elk ervan werpt een licht op het verhaal van dit land en zijn bevolking en onthult de geheimen van een verborgen Amerika.