Supertieners Wonder Woman, Supergirl, Bumblebee, Batgirl, Zatanna en Green Lantern vechten als leerlingen van Metropolis High tegen misdaad, huiswerk en verliefdheid.
In de nasleep van de moord op Bruce Wayne gaat zijn opstandige geadopteerde zoon een onwaarschijnlijke alliantie aan met de kinderen van Batmans vijanden wanneer ze allemaal worden beschuldigd van het doden van de Caped Crusader. Als de meest gezochte criminelen van de stad moet deze afvallige bende buitenbeentjes vechten om hun naam te zuiveren. Maar in een Gotham zonder Dark Knight om de stad te beschermen, verandert deze in de gevaarlijkste die het ooit is geweest. Er komt echter hoop uit de meest onverwachte hoek, aangezien dit team van niet bij elkaar passende voortvluchtigen de volgende generatie helden zal worden die bekend staat als de Gotham Knights.
Gebaseerd op een klassieke tekst vertelt het drama het verhaal van een koninklijke familie die op tienjarige leeftijd in de steek wordt gelaten vanwege een profetie die zei dat hij zijn vader zou vermoorden. Naarmate hij ouder wordt, krijgt hij te maken met twee delen van hem die strijden tussen goed en kwaad.
Op een continent dat wordt geregeerd door chaos, hebben de Heren de macht van een heilig zegel dat de chaos kan kalmeren en de mensen kan beschermen. Voordat iemand het echter beseft, laten de heersers hun geloof om de chaos te zuiveren terzijde en beginnen in plaats daarvan met elkaar te vechten om elkaars heilige zegels om heerschappij over elkaar te verwerven. Siluca, een geïsoleerde magiër die de Heren veracht omdat ze hun geloof hebben opgegeven, en een rondzwervende ridder genaamd Theo, die op reis is om op een dag zijn geboortestad te bevrijden, leggen een eeuwige eed af om samen te werken om dit continent dat wordt gedomineerd door oorlogen en chaos te hervormen.
De megalomane superschurk M.O.D.O.K. of 'The Mental Organism Designed Only for Killing', heeft lang zijn droom nagestreefd om ooit de wereld te veroveren. Maar na jaren van tegenslagen en mislukkingen in zijn gevechten tegen de machtigste helden van de aarde, zit M.O.D.O.K. zijn kwaadaardige organisatie A.I.M. aan de grond. Verdreven als A.I.M.'s leider, terwijl hij ook te maken heeft met een huwelijkscrisis, staat M.O.D.O.K. klaar om zijn grootste uitdaging tot nu toe aan te gaan: een midlifecrisis!
In een niet zo verre toekomst, waarin planeten in de hele Melkweg met elkaar verbonden zijn door spoorwegen, zijn er twee krachten die treinpassagiers beschermen: Space Panzer Grenadiers (SPG) en de Space Defense Force (SDF).
Het verhaal gaat over Manabu Yuuki, die ervan droomt zich bij de SDF aan te sluiten en in de voetsporen van zijn vader te treden. Er zijn echter obstakels onderweg en zijn moeder verbiedt hem omdat Manabu Yuuki's broer en vader ooit zijn omgekomen tijdens gevechten voor de SDF.
Optimus Prime, Bumblebee, Ratchet, Bulkhead en Prowl van de Autobots zijn een ruimtebrug aan het herstellen en vinden per toeval de Allspark. Wanneer blijkt dat er een Decepticonoorlogsschip in de buurt is, verbergen ze de Allspark in hun eigen schip. Na een heftige strijd worden ze naar de Aarde getransporteerd door een ontplofte ruimtebrug. Megatron stort ook neer op Aarde en wordt gevonden door een jonge ingenieur, Isaac Sumdac. Sumdac maakt van Megatrons onderdelen een enorme computer en weet zo in vijftig jaar tijd van Detroit een futuristische stad te maken. Hierdoor heeft Megatron met behulp van bewakingscamera's zicht over heel de stad.
Zes maanden geleden verloor Lord Hugh Disward (Huey) zijn excentrieke grootvader, Wes. Om het landgoed van Wes te erven, moet Huey de voogdij over de 'Mystic Archives of Dantalian' op zich nemen, die verboden kennis bevat en een mysterieus meisje genaamd Dalian. Dalian en Huey beginnen een onwaarschijnlijke samenwerking terwijl ze mysteries oplossen die zijn veroorzaakt door Phantom Books.
Originele Light Novel geschreven door Gakuto Mikumo en geïllustreerd door G-Yuusuke. Eerst aangepast aan manga door Chako Abeno, en opnieuw door Monaco Sena.
