17 jaar geleden, verschenen voor het eerst onsterfelijken op de slagvelden van Afrika. Later begonnen, zeldzame, onbekende nieuwe onsterfelijke levensvormen te verschijnen onder de mensen, en ze werden bekend als "Ajin" (demi-mensen). Net voor de zomervakantie, is een Japanse middelbare school student op slag dood bij een verkeersongeval op weg van school naar huis. Hij is echter opnieuw leven ingeblazen, en er werd een prijs op zijn hoofd geplaatst. Zo begint het leven van een jongen op de vlucht voor de hele mensheid.
De serie speelt in Magix, een andere dimensie waarin alle bewoners beschikken over magische krachten. Magix wordt voornamelijk bewoond door een groot aantal magische wezens zoals feeën, tovenaars, heksen, elfjes, trollen, reuzen en monsters en krijgers genaamd specialisten. Alfea is een kostschool voor feeën, Wolkentoren een school voor heksen en Red Fountain een school voor specialisten. De drie scholen bevinden zich in Magix.
Prins Pietro is de half mens, half drakenprins van het koninkrijk Popolocrois. Nadat de kwaadaardige GamiGami het koninkrijk probeert over te nemen, verschijnt een mysterieus meisje genaamd Hyuu in het bos nabij Popolocrois Castle, wat het begin is van een avontuur voor Pietro, zijn heksenvriend Narcia en al hun vrienden.
Een broer en zus die niet samen zijn opgegroeid en elkaar niet meer herkennen, komen tegenover elkaar te staan in een oorlog vol drugs, misdaad en verraad.
Invertia was een meteorenstorm die in de 20e eeuw een ongekende ramp veroorzaakte. Door deze ramp werden talloze steden over de hele wereld verwoest. Binnen de meteoor werd echter een onbekend element genaamd mana ontdekt. Het zorgde ervoor dat de menselijke technologie snelle vooruitgang kon boeken, waardoor een nieuwe soort superkrachtige mensen ontstond, de Star Pulse Generation (Genestella). De Festas (Star Warrior Festivals) organiseren gevechten tussen Genestella in een stad met zes academies genaamd ‘Rikka’, ook wel bekend als ‘Asterisk’.
Beursstudent Ayato Amagiri stapte over naar de Seidoukan Academie om zijn eigen wens te vervullen, waarbij hij zweerde dat hij ook in deze stad zou vechten.
Uit het niets begonnen monsters die meestal onder het aardoppervlak leefden de aardse wereld aan te vallen. Ze werden de Underground Hades Empire Infershia genoemd. De Ozu broers en zussen van Makito, Houka, Urara, Tsubasa en Kai horen van hun moeder, Miyuki, dat zij de Tovenaars van Justitie zijn om zich te verzetten tegen de Infershia. De broers en zussen zijn verbijsterd door zo'n onverwachte gebeurtenis. Echter, zonder aarzeling, valt Miyuki de Infershia aan, en de broers en zussen van Ozu worden gedwongen samen te komen om als één te vechten.
Kamala Khan, een geweldige studente, fervent gamer en vraatzuchtige fanfictieschrijfster, heeft een speciale affiniteit met superhelden, met name Captain Marvel. Ze worstelt echter om thuis en op school te passen - dat wil zeggen, totdat ze superkrachten krijgt zoals de helden waar ze altijd naar heeft opgekeken. Het leven is makkelijker met superkrachten, toch?