In de jaren 2030 is de aarde overspoeld door de blauwe, gemuteerde insectachtige wezens die mensen doden en oogsten voor voedsel. Het grootste deel van de overlevende mensheid is verhuisd naar Second Earth, een enorm ruimteschip dat in een baan om de planeet draait. Yuji en Marlene moeten samenwerken om Second Earth te bereiken en tegen de Blue te vechten.
Voor Haruyuki is het echte leven een verschrikking. Met zijn kleine en gedrongen figuur is hij niet bepaald een rokkenjager, maar een populair slachtoffer van de intimidatie van de school hooligans. Hij vindt zijn toevlucht in de virtuele wereld, waar hij zijn passie, squash, kan nastreven. Alleen Kuroyukihime slaagde erin hem erin te verslaan. Het mooie en populaire meisje doet Haruyuki een heel speciaal aanbod, een computerprogramma genaamd Brain Burst, waarmee hij de tijd in het echte leven praktisch kan stoppen. Deze mogelijkheid is echter niet tevergeefs, alle gebruikers moeten regelmatig tegen elkaar strijden en winnen, anders blokkeert het programma zichzelf voor altijd voor hen.
Volg Hans en Grietje terwijl ze uit hun eigen verhaal wandelen en in een warrig en griezelig grappig verhaal belanden vol bizarre en beangstigende verrassingen.
Om de paar jaar concurreren prachtige vrouwelijke krijgers uit het hele land in het Blade -toernooi van de Queen's Blade om de heerser van het land te worden. Het is een serie die net zoveel van geweld houdt als het een hekel heeft aan kleding en ingewikkelde plots.