Wanneer Kouichi op zijn nieuwe school aankomt, voelt hij meteen iets beangstigends in de sfeer van zijn nieuwe klas, iets waar geen enkele leerling over wil praten en dat verband lijkt te houden met een mysterieus en stil meisje.
Nadat Taira no Kiyomori aan de macht is gekomen, wordt de Minamoto-clan verbannen. Minamoto no Yoritomo ontmoet Masako, de zus van Hōjō Yoshitoki, en trouwt later met haar. Na dit huwelijk beginnen de wielen van Yoshitoki's lot te draaien.
Al meer dan een eeuw beschermt de mysterieuze Hellsing Organization in het geheim het Britse Rijk tegen de ondoden. Toen Sir Integra Hellsing het hoofd van de organisatie werd, erfde ze ook het ultieme wapen tegen deze bovennatuurlijke vijanden: Alucard, een malafide vampier die mysterieuze en angstaanjagende krachten bezit. Nu moet Hellsing omgaan met een gevaarlijker dreiging dan vampiers.