Mark Lilly werkt bij de sociale dienst voor de stad New York. Hij moet immigranten in the USA bijstaan, wat geen makkelijke baan is. Hij moet zich aanpassen aan onmogelijke mutaties. Allemaal willen zij een kans in het land.
De actie speelt zich af in een alternatieve realiteit, waar sinds het begin van de jaren tachtig in Japan enorme robots worden vervaardigd, die de algemene naam 'Labors' hebben gekregen omdat ze zich bezighouden met civiel werk zoals de bouw. De proliferatie van deze robots leidde tot de noodzaak om politie-eenheden op te richten die daarin gespecialiseerd waren, en om politie-eenheden op te richten die gebruikt konden worden om de anderen te controleren, de 'Patlabors'. Het verhaal begint in 1998 en concentreert zich op de tweede speciale voertuigdivisie van de politie van Tokio.
Een beschut meisje krijgt een spoedcursus overleven wanneer een mutantenaanval haar naar de oppervlakte stuurt, ver weg van de veiligheid van haar ondergrondse huis.
Over ontwikkeling en drukte in Japan hebben veel van zijn inheemse geesten gedwongen hun huizen te verliezen. Door problemen veroorzaakt door de dakloze geesten werd een nieuw beroep gecreëerd, de Ghost Sweepers (GS). Als privé-exorcisten worden ze ingehuurd en dienen ze alleen de hoogste bieder om te overleven in de moordende zakenwereld. Hiervan zou de Mikami GS Company, geleid door de 20-jarige Reiko Mikami en haar twee assistenten, de 17-jarige jongen Tadao Yokoshima en het spookmeisje Okinu, de beste zijn.
Minami Hiromi is een FBI-agent die voor een beperkte tijd vanuit de VS Japan bezoekt. Minami verloor zijn gezichtsvermogen als gevolg van een ongeval in het verleden en hij wordt de 'laatste man' bij de FBI genoemd, wat hem de laatste troefkaart noemt om een zaak te beëindigen met zijn sterke gevoel voor analyse, geur en aanraking. Godo Shintaro is toegewezen om Minami bij te staan. Godo, afkomstig uit een familie die al generaties lang commissaris van het Korps Nationale Politie is, heeft een buitengewoon rechtvaardigheidsgevoel en is bereid tot het uiterste te gaan om de criminelen te pakken te krijgen. Minami, die altijd klaar staat om hulp te vragen, en Godo, die nooit iemand heeft vertrouwd behalve zichzelf, worden een duo en werken samen om zaken op te lossen.
Wanneer de adviseur van de koning een heksenjacht start, zijn ook de Makai Knights en Makai Priests het doelwit van de koninklijke troepen, ook al zijn deze twee groepen feitelijk verplicht de bevolking te beschermen. Een van de priesteressen is al veroordeeld om op de brandstapel te sterven en bevalt van een zoon, Leon Lewis. De baby wordt gered door zijn vader, een Makai Knight, en ontmoet zijn moeder nooit. Leon groeit op als een afstammeling van de Golden Knights en erft uiteindelijk hun Gouden pantser. Ondertussen profiteert de koninklijke adviseur van de slechte gezondheid van Zijne Majesteit om zelf de macht te grijpen en prins Alfonso en zijn moeder het land uit te jagen. Hij is nu op zoek naar de legendarische Gouden Ridder in de hoop samen met hem zijn koninkrijk te kunnen heroveren.
Een vrouw stapt in een vreemde machine en verandert in... een kipnugget! Haar vader en bewonderaar beginnen een bizarre zoektocht om haar terug te brengen.
Yuuki bevindt zich plotseling in het uniform van een dienstmeisje in een herenhuis. Nadat ze naar de eetkamer is gegaan, ontmoet ze vijf andere meisjes, allemaal in precies dezelfde outfit. Al snel komen ze erachter dat het landhuis vol zit met dodelijke wapens en vallen, en dat ze alleen kunnen ontsnappen als ze het meest gruwelijke spel ooit spelen...
Het verhaal vertelt over een jonge wapen verkoper genaamd Koko Hekmatyar en haar team dat voornamelijk bestaat uit ex-militairen en huurlingen. Het verhaal begint wanneer een nieuwe rekruut zich bij Koko's team voegt, een nogal vreemde jongen genaamd Jonah die, ondanks zijn grote vaardigheid in de strijd, een hekel heeft aan wapens, omdat hij daardoor zijn ouders heeft verloren.
Door een ziekte die slachtoffers in bloedzuigende vijanden verandert, nemen twee beste vrienden het tegen elkaar op in een gevecht voor de toekomst van de mensheid.
