Zeepiratenkapitein Harlock en de dwalende samoerai Tochiro arriveren in de Verenigde Staten aan de westelijke grens. Samen met een mysterieuze vrouw die ze onderweg ontmoeten, dagen de twee vrienden seksringen, bandieten en een corrupte sheriff uit. Ze zijn op zoek naar een verloren clan van Japanse immigranten, en ze zullen Gun Frontier van begin tot eind scheuren totdat ze ze vinden.
Georgia en Euphimia zijn goeie vriendinnen. Euphemia's vader is net gestorven en ze moet naar Texas toe om bij haar oudere zus Sara te gaan wonen, die zelf al moeder is. Ze maakt de oorlog tegen de Mexicanen mee en ziet hoe Sara alle vrouwen in veiligheid brengt, terwijl de mannen de vijand bevechten. Na de oorlog trekt ze naar de stad Georgia waar ze opgroeit met het vechten tegen vooroordelen en andere sociaal-politieke zaken.