Middelbare scholier Chiyo Sakura is verliefd op klasgenoot Umetarō Nozaki, maar wanneer ze haar liefde aan hem bekent, beschouwt hij haar voor een fan en geeft haar een handtekening. Als ze zegt dat ze altijd bij hem wil zijn, nodigt hij haar uit bij hem thuis en laat haar helpen bij enkele tekeningen. Chiyo ontdekt dat Nozaki eigenlijk een bekende shōjo-mangakunstenaar is genaamd Sakiko Yumeno. Ze stemt er dan mee in om zijn assistent te zijn om dichter bij hem te komen. Terwijl ze aan zijn manga Let's Fall in Love (恋しよっ) werken, komen ze andere klasgenoten tegen die hen helpen of als inspiratie dienen voor personages in de verhalen.
In de moderne wereld sterft een eenzame man en reïncarneert in een andere wereld. Als baby gered van een tragedie door een briljante wijze genaamd Merlin, wordt de baby opgevoed als 'Shin Walford' en ondergaat hij training in zowel magie als vechtsporten om de monsters te doden die het land verwoesten. Op 15-jarige leeftijd is Shin schokkend krachtig geworden. Maar zijn grootvader Merlijn is vergeten hem het gezonde verstand van deze wereld te leren.
Als gevolg hiervan schrijft Shin zich in voor de Magische Academie van het koninkrijk om zijn vaardigheden aan te scherpen en volwassen te worden onder andere tieners. Een normaal leven leiden is echter onmogelijk, aangezien hij vrijwel zodra hij aankomt een plaatselijke beroemdheid wordt.
Dit verhaal volgt het leven van Shin Walford op de middelbare school in de hoofdstad, terwijl hij nieuwe vrienden maakt, de wereld leert kennen en de verschillende krachten van het kwaad die hem en zijn stad omringen, bestrijdt.
De actie speelt zich af in een alternatieve realiteit, waar sinds het begin van de jaren tachtig in Japan enorme robots worden vervaardigd, die de algemene naam 'Labors' hebben gekregen omdat ze zich bezighouden met civiel werk zoals de bouw. De proliferatie van deze robots leidde tot de noodzaak om politie-eenheden op te richten die daarin gespecialiseerd waren, en om politie-eenheden op te richten die gebruikt konden worden om de anderen te controleren, de 'Patlabors'. Het verhaal begint in 1998 en concentreert zich op de tweede speciale voertuigdivisie van de politie van Tokio.
Het verhaal van Hugh Knight, een opkomende hartchirurg die begaafd, charmant en onfeilbaar is. Hij is een levensgenieter die door zijn talent gelooft dat hij buiten de regels kan leven. Zijn 'work hard, play harder'-filosofie staat op het punt terug te komen en hem te bijten.
Na de brand in zijn huis en de ontsnapping aan zijn vader, dwaalt Kôshi Nagumo, een leerling van de 5e klas, op straat. Hongerig en liggend op de grond ontmoet hij een studente die hem naar haar hostel zal brengen en hem een vreemd voorstel zal doen: de huishoudster worden van het hostel, dat naar verluidt in de problemen zit...
Toen een metalen frame op het punt stond op hem te vallen, wordt Tsukasa Atsumi, een gewone werknemer, in extremis gered door Shizuri Ideura, een geniale kunoichi. Ze ontdekt dat zijn samoerai-afkomst hem bijzonder kwetsbaar maakt voor aanvallen van demonen en biedt hem bescherming, op één voorwaarde: dat hij dagelijks voor haar zorgt. Tsukasa accepteert deze vreemde deal en wordt huisvrouw, maar realiseert zich uiteindelijk dat zijn weldoenster niemand minder is dan een eenvoudige otaku Neet die zich liever wijdt aan haar passie dan aan haar verplichtingen als ninja...