Dankzij het toeval ontsluieren de excentrische, amateuristische detective Dirk en zijn onwillige assistent Todd een ingewikkeld en gevaarlijk bovennatuurlijk mysterie.
Pinky en Brain zijn genetisch verbeterde laboratoriummuizen die in een kooi in de onderzoeksfaciliteit van Acme Labs verblijven. Brain is egocentrisch en intrigerend; Pinky is goedaardig maar zwakzinnig. In elke aflevering bedenkt Brain een nieuw plan om de wereld over te nemen, dat uiteindelijk op een mislukking uitloopt, meestal als gevolg van Pinky's idiotie, de onmogelijkheid van Brain's plan, Brain's eigen arrogantie of gewoon omstandigheden waar ze geen controle over hebben.
In de greep van de mensheid op de toekomst begint een sinistere vijand die alleen bekend staat als Gargoyle zijn plannen om de wereld over te nemen. Nadia moet, met de hulp van een jonge uitvinder, Jean Ratlique, en kapitein Nemo van de onderzeeër Nautilus vechten om de wereld te redden van Gargoyle en Neo-Atlantis.
Terwijl nieuwe schurken Gotham City van de toekomst overspoelen, hangt de ouder wordende Bruce Wayne de cape van de ooit onoverwinnelijke Batman op. Maar wanneer de onrustige tiener Terry McGinnis op het geheim van de Dark Knight stuit, wordt een nieuwe alliantie gesmeed. En een triomfantelijke nieuwe Batman is geboren.
In een wereld geplaagd door wezens die bekend staan als Kaiju, streefde Kafka Hibino ernaar om dienst te nemen bij The Defense Force. Hij belooft dat hij samen met zijn jeugdvriendin Mina Ashiro in dienst zal treden. Al snel neemt het leven ze op verschillende manieren mee. Terwijl hij bezig is met opruimen na Kaiju-gevechten, ontmoet Kafka Reno Ichikawa. Reno's vastberadenheid om zich bij de Defensiemacht aan te sluiten wakkert Kafka's belofte aan om zich bij Mina aan te sluiten en de mensheid te beschermen.
Honderden jaren in de toekomst is het menselijke ras bijna uitgestorven. De laatste overlevenden ontdekken echter een manier om hun bewustzijn terug in het verleden te sturen. Deze "travelers" (reizigers) komen vervolgens terecht in de lichamen van normale mensen uit de 21e eeuw. Dit zijn o.a. een FBI agent, een gehandicapte vrouw en haar verzorger, een middelbare scholier, een alleenstaande moeder en een verslaafde student. Samen hebben ze een geheime missie om de toekomst van de mensheid te veranderen. Uiteraard is dit geen geringe opgave, vooral omdat het leven in de 21e eeuw moeilijker blijkt te zijn dan verwacht.
Direct nadat Ryu Sun-jae, een topster, zijn leven beëindigt, belandt Im Sol, zijn topfan, op de een of andere manier op een moment dat ze op de middelbare school zaten en probeert hij hem te beschermen. Een fantasieromantiek ontvouwt zich waarin mensen die elkaar op tijd hebben gemist elkaar eindelijk ontmoeten.
De serie draait om het conflict tussen een groep rebellen uit het jaar 2077 die in 2012 door de tijd reizen naar Vancouver, BC, en een politieagent die hen per ongeluk vergezelt. Ondanks dat ze vele jaren te vroeg is, besluit de rebellengroep haar gewelddadige campagne voort te zetten om te voorkomen dat bedrijven van de toekomst regeringen vervangen, terwijl de politieagent hen probeert tegen te houden zonder aan iemand te onthullen dat zij en de rebellen uit de toekomst komen.