Holy Knight is het verhaal van een jonge mannelijke vampierdoder die met tegenzin verliefd wordt op een mooie vrouwelijke vampier uitwisselings student en hun persoonlijke strijd om hun bloedige, voorbestemde conflict te vermijden.
Wanneer de planeet Brigadoon aan de hemel verschijnt, wordt Marin aangevallen door een vreemde mecha genaamd Monomakia. In een oud heiligdom vindt ze een ampul met daarin Melan, een hoekige blauwe mecha die zweert haar te verdedigen.
De Zuid-Afrikaanse spionne Queen Sono komt in een schandelijk web van handel en politiek terecht terwijl ze de waarheid probeert te achterhalen over haar moeders dood.
