In de nabije toekomst wordt het leven op aarde vernietigd, met uitzondering van een klein gebied in Oost-Europa. Het Russische leger vecht tegen de hordes overgebleven mensen die door buitenaardse wezens worden gecontroleerd en probeert een succesvolle invasie door een buitenaardse macht te voorkomen.
De Bunker volgt een team van de Antwerpse cel van de Belgische Staatsveiligheid, die opereert vanuit haar ondergronds hoofdkwartier: de Bunker. Als buitendienst verzamelen de agenten informatie op het veld, om zo tijdig een belangrijke dreiging of ramp te voorkomen. Die bedreiging kan van alle kanten komen: extreemrechts en -links, terrorisme, economische spionage, cybercriminaliteit en sektes. Op het team rust een enorme verantwoordelijkheid en de agenten zijn -door de interne geheimhouding- vaak enkel op elkaar aangewezen. Hun band is hecht, maar de druk is zonder meer groot.
Zeer intelligent, Julie is een vindingrijk en vooral inventief jong meisje. In het bijzonder creëert ze een robot, Floppy, die haar overal volgt en haar beste vertrouweling is. Ondanks haar jonge leeftijd gaat ze naar de universiteit en wordt ze verliefd op Michel, een motorliefhebber die veel ouder is dan zij, die liever over de weg reist dan te studeren. Deze liefde voor mechanische objecten zal ze samenbrengen en Julie is vastbesloten om van hem haar minnaar te maken. Helaas voor haar merkt hij het niet!
