Barkeepster Jaime's leven gaat niet over rozen. Ze werkt keihard en heeft daarnaast nog de zorg over haar rebelse tienerzusje Becca. Opeens krijgt Jaime een verwoestend auto-ongeluk en komt haar leven aan een zijden draadje te hangen. Het enige dat haar nog kan redden, is een nieuwe supergeheime operatie, waarbij zij bionische lichaamsonderdelen krijgt aangemeten en zal beschikken over buitenaardse krachten. De organisatie die hierachter zit, verwacht in ruil hiervoor Jaime's medewerking tijdens geheime missies. Ze gaat een geheel nieuw bestaan tegemoet waarin ze offers moet brengen en moet leren omgaan met haar nieuwe, niet alledaagse gaven.
The Music Kingdom bevat muzikale schatten genaamd Sound Jewels, die samen het 'Song of Blessings' produceren. De Sound Jewels worden gestolen door Maou, die ze verandert in Negative Jewels. Via de Dokudoku-dan worden de negatieve juwelen gebruikt om mensen in negatieve juweliers te veranderen om een negatieve uitstraling te verspreiden die Maou kan gebruiken in zijn plan om de mensenwereld te veroveren door een kwaadaardig lied te componeren. Om de Geluidsjuwelen terug te krijgen, stuurt de godin van het Muziekrijk de Fairy Rhythms; Poppun, Rocky en Kuranosuke, naar de mensenwereld om hulp te zoeken.
Haru Irei is een jonge jongen die fan is van de Gundam-saga; hij raakt dus in de ban van de robotmodellen van de franchise, maar vindt in de winkel alleen een onbekende robot, de Beginning Gundam, die hij samen met zijn vriend Kenta Sakazaki in elkaar zet. Deze laatste neemt hem vervolgens mee naar een Gunpla-toernooi, waarbij de deelnemers strijden via een gevechtssimulator waarmee ze virtueel de controle over hun model kunnen overnemen in een 3D-omgeving.
In een alternatieve wereld is de Koude Oorlog 140 jaar blijven bestaan. Als gevolg hiervan was de wereld verdeeld in twee facties: het West -blok en het Oost Block. Terwijl de Koude Oorlog voortgaat, stijgen de spanning tussen de twee facties, evenals de hoeveelheid nucleaire wapens die ze hebben. Mylene Hoffman is een vrouwelijke cyborg die een spion is voor het West -blok. Samen met drie andere agenten neemt Mylene deel aan verschillende missies uitgegeven door haar superieuren.
In deze wereld bestaan er drie identiek uitziende mensen die tussen hen een energie-achtige kracht genaamd Terra splitsen. Deze energie kan worden toegeschreven aan de hoeveelheid geluk of levensenergie die een individu bezit. Er bestaan ook wezens die de menselijke wereld observeren en het evenwicht (coëxistentie-evenwicht) van Terra behouden. Deze wezens beschikken over capaciteiten die die van normale mensen overtreffen. Ze leven ondergedoken op plaatsen die bekend staan als Pure Places, in stammen. Ze worden de Terra Guardians genoemd. Dit is een strijdverhaal dat begint met een toevallige ontmoeting tussen een mensenjongen genaamd Keita en een jong Terra Guardian-meisje genaamd Kuro.
