De 'Blast'-zaak: een catastrofe van onvoorstelbare proporties die talloze levens eist en degenen die de ramp overleven verminkt achterlaat. Om deze mensen in staat te stellen te blijven leven, ontwikkelt de R.U.C.-organisatie de ‘Resemble’-technologie, waarmee verloren lichaamsdelen kunnen worden vervangen. Maar de zwarte markt bloeit en criminelen verschijnen steeds vaker en dankzij deze technologie muteren ze in bijna onoverwinnelijke vechtmachines. Roy Revant, een premiejager, zit achter deze criminelen aan. De noodlottige man verloor zijn dochtertje Rita tijdens de Blast Fall. Ook al is het twaalf jaar geleden, hij zoekt nog steeds naar enig teken van leven van haar. Roy hoopt op een wonder. Een wonder dat hem ervan weerhoudt zichzelf volledig in zijn pijn te verliezen. Op een nacht valt dit wonder letterlijk uit de lucht in de vorm van het jonge meisje Solty en redt zijn leven.
De legendarische zwaardsmid Kiki Shikizaki creëerde in zijn carrière 1.000 zwaarden. Hoe meer zwaarden een land bezit, hoe groter de kans is dat het een oorlog wint. Toen de shogun als overwinnaar uit de strijd kwam, verzamelde hij 988 zwaarden, maar dit waren slechts de ‘oefenstukken’. De laatste twaalf zwaarden waren de bekroning van Kiki’s carrière. Elk van hen is zo krachtig dat één enkele man er een leger mee zou kunnen verslaan.
Togame, de strateeg van de shogun, krijgt de opdracht deze zwaarden te verzamelen. Aanvankelijk huurde ze een ninja in, maar de waarde van elk zwaard is zo hoog dat de hele ninjaclan schurkenstaten werd zodra ze er een in handen kregen. Ze vertrouwde toen op een andere krijger, maar hij hield het zwaard voor zichzelf. Haar laatste hoop is nu Shichika, de zevende en laatste leerling van de Kyotoryuu School.
Volg het pad van het wapen met het rode handvat vanaf zijn onschuldige begin, terwijl het in de handen belandt van goede en slechte overlevenden, bekende en nieuwe.
Ryza is een gewoon meisje. Ze is het saaie dorpsleven beu en ontvlucht het dorp om met haar goede vrienden op een geheime locatie samen te komen om over hun dromen te praten en spannende avonturen te plannen. Op een dag besluiten de vastberaden Ryza en zijn gezelschap naar het verboden 'eiland aan de overkant' te gaan als hun eerste verkenningstocht. Samen met de alchemist en andere vrienden die ze daar ontmoeten, beleven ze een 'zomeravontuur' dat ze nooit zullen vergeten.
'Hundred' - dat is het enige wapen dat de mysterieuze levensvorm 'Savage' ervan kan weerhouden de aarde te bezoeken. De hoofdpersoon, Kisaragi Hayato, wil met deze Honderd een Martial Arts Master worden. Hij slaagde erin de slagschipuniversiteit Little Garden binnen te komen. Maar... 'Ik wilde je zien, Hayato!!!' 'H-Hoe weet je mijn naam?' Bij de huisgenoot, Emil Crossford, die hem op de een of andere manier goed kent (?), krijgt Hayato een ongemakkelijk gevoel. Bovendien wordt hij vlak na de toegangsceremonie voor een duel gevraagd door de sterkste vechtsportmeester van de campus, 'Koningin' Claire Harvey...!? De ultieme academiestrijd begint hier!
Nadat politieagent Daigo Agawa een groot incident heeft veroorzaakt, neemt hij zijn vrouw en dochter mee naar het afgelegen bergdorpje Kuge. Het lijkt de perfecte plek om bij te komen van de beproeving, ondanks de mysterieuze verdwijning van een vorige officier die daar was geplaatst. Op een dag wordt het lichaam van een oude vrouw op de berg gevonden. De familie Goto zegt dat ze is aangevallen door een beer, maar Daigo merkt een menselijke bijtvlek op. Al snel wordt duidelijk dat niet alles is wat het lijkt in het dorp.