Neotopia is een wereld waar mensen en robots in vrede en harmonie leven. Het wordt echter plotseling binnengevallen door de kwade krachten van de Dark Axis. De Dark Axis probeert alle organische levensvormen in steen te veranderen en de controle over de AI's van alle robots en mobiele burgers over te nemen. Om deze invasie tegen te gaan, wordt in het geheim de Super Dimensional Guard (S.D.G.) gevormd. Kapitein Gundam, de held van de SDG, wordt vergezeld door Shute, een dappere jonge jongen wiens aanmoediging en steun hem helpen zijn missies te volbrengen.
